經(jīng)濟(jì)快捷的SNP位點研究方法-SNP基因分型

SNP，全稱 Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因組上單個核苷酸的變異。目前很多人仍然使用測序法來進(jìn)行研究，具有準(zhǔn)確、直觀的優(yōu)點。但有一種方法，能間接的研究SNP，且經(jīng)濟(jì)快捷，那就是——SNP基因分型。

其實現(xiàn)原理：熔解溫度（melting temperature,Tm）是指吸光值增加到最大值的一半時的溫度稱為DNA的解鏈溫度或熔點。當(dāng)實時熒光定量PCR中的熒光探針與靶基因錯配，即靶基因序列上產(chǎn)生了核苷酸變異，他們的熔解溫度比較低。相對而言，沒有突變的靶基因與探針雜交的熔解溫度較高。通過區(qū)分熔解溫度的差異，來區(qū)分突變型和未突變型（野生型）。

進(jìn)行SNP基因分型需要注意：

1、將突變的位點放在探針中間。

2、保證兩條探針的熔解溫度相同。

熒光探針中，Taqman探針可進(jìn)行SNP基因分型。推薦Applied Biosystems公司的Taqman MGB探針，相對普通Taqman探針，與錯配序列的熔解溫度相差更大。

分子信標(biāo)也可用于SNP基因分型。他的莖環(huán)結(jié)構(gòu)比一般線性的分子探針更適合SNP分型，莖環(huán)結(jié)構(gòu)與錯配序列雜交的熱穩(wěn)定性更低，熔解溫度相差也更大。

讀者們可根據(jù)自己的實驗需求，選擇合適的方法進(jìn)行分析。